MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 10436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019793	CAGGA	2	10	12	21	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019793	CTG	2	6	87	92	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019793	CAC	2	6	107	112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_019793	CAA	2	6	118	123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019793	A	6	6	144	149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019793	TTCT	2	8	391	398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019793	CGG	2	6	452	457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019793	CG	3	6	1219	1224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019793	ACG	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019793	GCA	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019793	CGG	2	6	2573	2578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019793	ACG	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019793	TAA	2	6	2712	2717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019793	CCG	2	6	2779	2784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019793	TCA	2	6	2816	2821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019793	GCG	2	6	2822	2827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019793	CGG	3	9	2829	2837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019793	CTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019793	CAG	3	9	2933	2941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019793	CCG	2	6	2956	2961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019793	ACC	2	6	2997	3002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_019793	GAA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019793	CTT	2	6	3314	3319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019793	ATCC	2	8	3335	3342	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019793	CTG	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019793	CT	3	6	3400	3405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019793	AAGCG	2	10	3537	3546	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019793	CAG	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019793	AAAC	2	8	3605	3612	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019793	ACAG	2	8	6010	6017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019793	TCCT	2	8	6037	6044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019793	CG	3	6	6057	6062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019793	GC	3	6	10364	10369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019793	TCC	2	6	10370	10375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_019793	GC	3	6	10430	10435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019793	CTT	2	6	10441	10446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019793	GCG	2	6	10456	10461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019793	CTG	2	6	11893	11898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019793	AGG	2	6	11915	11920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019793	GGTG	2	8	13547	13554	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019793	AGC	2	6	13593	13598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019793	GC	3	6	13617	13622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019793	ACC	2	6	13646	13651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019793	AGG	2	6	13672	13677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019793	GCA	2	6	13697	13702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019793	CAACAC	2	12	13703	13714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019793	GC	3	6	13777	13782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019793	CTCCC	2	10	16059	16068	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
49	NC_019793	ACC	2	6	16117	16122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_019793	CG	3	6	17149	17154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019793	CAC	2	6	17171	17176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019793	GCG	2	6	21552	21557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019793	GGA	2	6	21559	21564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019793	TCC	2	6	21576	21581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_019793	GC	3	6	21794	21799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019793	CTC	2	6	21816	21821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_019793	GAT	2	6	21828	21833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019793	TCT	2	6	21920	21925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019793	CAT	2	6	21968	21973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019793	CGG	2	6	22019	22024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019793	GC	3	6	22145	22150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019793	CGT	2	6	22160	22165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019793	GC	4	8	22166	22173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019793	GAG	2	6	22206	22211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019793	CTG	2	6	22248	22253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019793	GAA	2	6	22266	22271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019793	GTC	2	6	22284	22289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019793	ACG	2	6	22327	22332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019793	TCC	2	6	22413	22418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019793	GCA	2	6	23918	23923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019793	CCA	2	6	25340	25345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_019793	AC	3	6	25372	25377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019793	CCA	2	6	25454	25459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_019793	CGG	2	6	25599	25604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019793	CCGG	2	8	25699	25706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019793	TC	3	6	25710	25715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019793	GCGCA	2	10	26729	26738	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_019793	GCCC	2	8	26748	26755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_019793	GCC	2	6	26758	26763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_019793	TGA	2	6	26768	26773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019793	GCA	2	6	26802	26807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019793	GTT	2	6	26809	26814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019793	GCC	2	6	26855	26860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019793	GCG	2	6	28289	28294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019793	AG	3	6	28736	28741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019793	GC	3	6	28824	28829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019793	GGC	2	6	28840	28845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019793	CGT	2	6	28887	28892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019793	CACC	2	8	28908	28915	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_019793	GCCG	2	8	28969	28976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019793	TGC	2	6	28994	28999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019793	C	6	6	28999	29004	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_019793	GCTG	2	8	29096	29103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019793	AGC	2	6	29131	29136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019793	CGT	2	6	29168	29173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019793	CCG	2	6	29185	29190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_019793	CGGGC	2	10	29350	29359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_019793	GC	3	6	29358	29363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019793	CAG	2	6	29418	29423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019793	CG	3	6	29442	29447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019793	CAG	2	6	29514	29519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019793	TCG	2	6	29521	29526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019793	TCC	2	6	29700	29705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019793	GAGCG	2	10	29706	29715	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019793	ACC	2	6	29726	29731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_019793	GCC	2	6	29765	29770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_019793	GAA	2	6	29783	29788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019793	CGT	2	6	29811	29816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019793	CGG	2	6	29877	29882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019793	GCAG	2	8	29889	29896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019793	GT	4	8	29902	29909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019793	CG	3	6	31542	31547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019793	CG	3	6	49052	49057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019793	GCC	2	6	51580	51585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_019793	TGC	2	6	52974	52979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019793	ATT	2	6	53003	53008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019793	GT	3	6	54351	54356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019793	TTC	2	6	54371	54376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019793	GT	3	6	56208	56213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019793	CCT	2	6	56265	56270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_019793	AT	3	6	56326	56331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019793	A	7	7	56332	56338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019793	CTCAT	2	10	56379	56388	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_019793	GCCG	2	8	61733	61740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019793	ACC	2	6	61745	61750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019793	TGG	2	6	62896	62901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019793	GC	3	6	62958	62963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019793	TAA	2	6	63035	63040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019793	AGG	2	6	63083	63088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019793	GGT	2	6	64396	64401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019793	CCG	2	6	64415	64420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019793	TGG	2	6	64432	64437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019793	TGC	2	6	65959	65964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019793	GCA	2	6	65970	65975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019793	ACT	2	6	65995	66000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019793	GCTGAA	2	12	67543	67554	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_019793	ATC	2	6	67583	67588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019793	TCG	2	6	67767	67772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019793	GTG	2	6	68337	68342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019793	AGC	2	6	68363	68368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019793	CGAT	2	8	68402	68409	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019793	CGGCC	2	10	68419	68428	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_019793	CGC	2	6	68442	68447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_019793	CG	3	6	68458	68463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019793	TC	3	6	69908	69913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019793	GGAAA	2	10	69918	69927	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_019793	CGG	2	6	75825	75830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_019793	CCGG	2	8	75835	75842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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